美国拉霍亚免疫学研究所(LJI)的教授亚历山德罗·塞特(Alessandro Sette)指出,公众对具有多种突变的病毒可能“逃避”T细胞免疫的担忧日益增加。
在一项新研究中,研究团队利用了免疫表位数据库(IEDB),该数据库汇集了全球免疫学家的重要发现,描述了免疫细胞如何识别微生物上的片段或“表位”。这些数据为研究人员提供了关于COVID-19疫苗或先前SARS-CoV-2暴露如何“训练”T细胞靶向SARS-CoV-2表位的深入理解。
研究人员提取了IEDB的数据,并开发了一个生物信息学管道,以预测T细胞对Pirola变异的反应。格里福尼(Grifoni)表示,研究团队基于先前SARS-CoV-2变体的实验和预测数据,模拟了T细胞对Pirola的反应。结果显示,大多数T细胞仍能靶向Pirola的表位。
总体而言,CD4+“辅助”T细胞应答识别的72%片段和89%的CD8+“杀伤”T细胞表位在变体之间保持不变或“保守”。然而,研究人员在Pirola的“Spike”蛋白上发现的保守T细胞表位较少,正如预期,这一蛋白包含了大多数突变。
此外,只有56%的CD4+“辅助”T细胞表位和CD8+“杀伤”T细胞表位在这一主要结构蛋白上是保守的。这一发现可能引发关注,因为当前的COVID-19疫苗仅设计用于教导免疫细胞识别和靶向Spike表位。
尽管如此,研究人员在仔细观察Spike片段时发现,96%的CD4+“辅助”T细胞表位和62%的CD8+“杀伤”T细胞表位非常相似,表明T细胞可能仍能识别这些表位。简而言之,Pirola变异在逃避T细胞识别方面的表现并不理想。
塞特强调,免疫系统识别的许多抗原表位在新的Pirola变异中依然保守。他们强烈预测,这种病毒仍将被T细胞识别。格里福尼补充道,T细胞可能会对Pirola的新突变产生新的反应,类似于他们在其他变异中观察到的情况。
研究团队认为,这可能是尽管病毒不断进化,仍未在Pirola感染病例或其他近期变种中观察到更严重疾病的原因。格里福尼强调,这些发现是基于预测,而非实际Pirola感染的观察结果。尽管如此,她认为,观察这些“计算机预测”如何在现实世界研究中反映出来是非常重要的。
参考文献:
预先存在的SARS-CoV-2特异性T细胞被预测交叉识别BA.2.86——(https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S1931312823004602)
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希望本篇文章《T细胞在抵御BA.2.86 COVID变种中的作用》能对你有所帮助!
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